首先我们应该对 JDK,JRE,JVM 有所认知，下面这个图就可以清晰的表述他们的关系：
JDK,JRE,JVM 的关系
一个更复杂的图：这是 J2SE 1.5 具体功能图表，在图的左边，我们可以清晰的看出哪些是JVM的范畴，哪些是JRE的范畴，哪些是JDK的范畴。
Java程序的执行逻辑
下面图演示的是如何打造一个个性化的Java启动器，这对我们理解Java执行的逻辑很有帮助。下图是以Window环境打造个性化的Java启动器的例子。
这幅图来自：
最常见的启动器是Sun在Java Runtime Environment的/bin目录中提供的启动器，就Windows平台而言，它们是java.exe和javaw.exe。前者运行时打开两个窗口：一个是接收System.out/err和启动器输出的控制台窗口，另一个是Java程序本身的窗口；javaw运行时不打开控制台窗口。
在J2SE/EE平台中，虚拟机以动态库的形式实现，也放在/bin目录下。动态库的名字在Windows中是java.dll，在Unix中是java.so。所谓“装入虚拟机”，就是指装入这个动态库。
找这个动态库的逻辑是依次按照下面搜索先后顺序去寻找：
- 先找当前目录下有没有JRE
- 再找父目录下有没有JRE
- 接着在PATH路径中找JRE
- 注册表HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/JavaSoft/Java Runtime Environment/ 查看CurrentVersion的键值指向哪个JRE（这当然是windows下特有的。）
这不像 .Net ，.Net 引入了全局应用缓存（GAC），一台机子，一个版本的 .Net Framework 就只有一套，就在GAC中，不用考虑这个寻找逻辑。
JRE 类库的寻找
JRE自带的基础类库主要是JRE/lib/rt.jar这个文件，包括了Java2平台标准版的所有类库。和JRE的版本一致。
JRE中由ClassLoader负责查找和加载程序引用到的类库，基础类库ClassLoader会到rt.jar中自动加载，其它的类库，ClassLoader在环境变量CLASSPATH指定的路径中搜索，按照先来先到的原则，放在CLASSPATH前面的类库先被搜到.
Java程序启动之前建议先把PATH和CLASSPATH环境变量设好。OS通过PATH来找JRE，确定基础类库rt.jar的位置。JRE的ClassLoader通过CLASSPATH找其它类库。
JDK 的安装
去 下载最新版本 JDK。 下载后安装。
Windows 下安装完毕后需要设置三个环境变量| JAVA_HOME | 指明JDK安装路径，就是刚才安装时的路径C:/Program Files/Java/jdk1.6.0_19，此路径下包括lib，bin，jre等文件夹（此变量最好设置，因为以后运行tomcat，eclipse，ant 等都需要使用此变量） |
| PATH | Path使得系统可以在任何路径下识别java命令，设为： %JAVA_HOME%/bin;%JAVA_HOME%/jre/bin |
| CLASSPATH | CLASSPATH为java加载类(class or lib)路径，只有类在classpath中，java命令才能识别，设为： .;%JAVA_HOME%/lib;%JAVA_HOME%/lib/tools.jar (要加.表示当前路径) %JAVA_HOME%就是引用前面指定的JAVA_HOME。 |
Linux 下则是要做如下设置（以我使用的 ubuntu 为例）：
下载完后，我们就开始安装了。(我们假设下载后的文件名为jdk1.6.bin)
在命令行下打开其所在文件夹，打chmod u+x ./jdk1.6.bin (更改可执行权限：u 表示该档案的拥有者，+ 表示增加权限，x 表示可执行) 然后./jdk1.6.bin 看到协议，一直敲Down键或者Enter键（协议还挺长的） 最后看到 Do you agree to the above license terms? [yes or no] 寻问是否接受，当然是打y 回车拉~ 然后就看到它解压缩 解压缩完后的默认文件名是jdk1.6.0 接着打 sudo cp –r jdk1.6.0 /usr/ （cp -r : 递归持续复制，用于目录的复制行为。） 把它复制到usr目录里去 好了，到这里就只差配置环境了 export JAVA_HOME=/usr/jdk1.6.0 export CLASSPATH=$CLASSPATH:$JAVA_HOME/lib:$JAVA_HOME/jre/lib export PATH=$JAVA_HOME/bin:$JAVA_HOME/jre/bin:$PATH:$HOMR/bin 打vi ~/.bashrc （vi 的命令参看：） 进入用户环境变量配置界面中，把上面的三行加入到最后，ESC，:wq 保存并退出 这样JDK就算配置好了~参看：
之后我们就可以写一个超简单的java程序。
依次： javac Test.java
java Test
来测试是否可以正常运行。
Eclipse 中我们也可以设置JDK的版本，
在我们的项目上右键Properties –> Java Compiler中将 –> Compiler compliance level 设成我们需要的版本即可。
需要注意的是：Eclipse不自带jdk，它只需要jre就可以运行（不需要javac），因为它自带编译器（plugin目录里有compile包）。
在运行时，则是由于JRE安装时已经在环境中添加java这个命令（无论windows还是Linux），eclipse便利用它启动startup.jar。但如果只用jre，因为没有源代码，eclipse就不能根据源码生成库中type的注释了。
如何查看当前Java运行环境的版本？
在命令行下面使用 java -fullversion 可以对当前版本的。
参考资料：
JDK，JRE，JVM，三者的区别与联系
SDK、JDK、JRE和JVM的关系总结
初步总结CLR和JRE运行机制
如何让java运行在指定版本的JRE中。
怎样运行JAVA程序
java程序运行机制及运行过程
关于JDK
打造个性化Java启动器
Linux系统下运行JAVA程序 JRE安装和配置
JDK、JRE、JVM之间的关系
JDK下载安装及其环境变量配置
Eclipse的编译器和Sun的javac还真不太一样
Eclipse设置项目jdk的问题